Caractéristiques uniques des Archaeas :

Bien que les Archaeas possèdent des similarités avec les eubactéries et les eucaryotes, elles possèdent quelques caractéristiques biochimiques uniques.

Chiralité des phospholipides :
Le stéréoisomère du glycérol qui est un constituant des phospholipides de membrane des Archaea est le L-glycérol alors que celui retrouvé dans les phospholipides de membrane des eubactéries ou des eucaryotes est le D-glycérol.

Chaines latérales de phospholipides :
Chez les eubactéries et les eucaryotes, les deux chaines latérales d’acides gras attachées au glycérol des phospholipides sont liées au glycérol par des ponts ester. Chez les Archaea les chaines latérales sont attachées par un pont éther. De plus, alors que les acides gras (généralement à 16 ou 18 carbones ou même plus longs) constituent la chaine latérale des phospholipides des eubactéries et des eucaryotes, les chaines latérales de phospholipides des Archaea sont des isoprènes branchés à 20 carbones. Les embranchements peuvent relier les chaines latérales ensemble et peuvent être inter ou intramoléculaires. Les embranchements peuvent relier deux phospholipides de monocouches différentes de la bicouche engendrant ainsi des phospholipides transmembranaires. Les isoprènes peuvent aussi s’enrouler pour former une structure en boucle de cinq carbones qui pourrait stabiliser la membrane de ces organismes dans les environnements extrêmes où ils vivent.